發(fā)布時(shí)間:2021-04-29來(lái)源:人民日報 姜曉丹
彭廣敦在做實(shí)驗。資料圖片
跨界自學(xué),將編程計算技術(shù)融入傳統生物學(xué)研究;從頭做起,組建多學(xué)科團隊……在中科院廣州生物醫藥與健康研究院研究員彭廣敦看來(lái),做科研最快樂(lè )的地方,就是取得一點(diǎn)進(jìn)步,就很有獲得感。不斷學(xué)習、不斷嘗試、不斷突破,他一直致力于揭示干細胞發(fā)育的規律,期待為醫學(xué)發(fā)展打開(kāi)一扇新的窗口。
在中國科學(xué)院廣州生物醫藥與健康研究院的實(shí)驗室里,80后研究員彭廣敦穿著(zhù)一件白大褂,全神貫注地操作著(zhù)顯微儀器。
顯微儀器下,藍色試劑浸染過(guò)的標本,薄薄一片。在彭廣敦的解說(shuō)中,每一個(gè)細胞都充滿(mǎn)生命的活力,“細胞成長(cháng)的過(guò)程就好比一場(chǎng)音樂(lè )會(huì ),不同的樂(lè )器發(fā)出不同的聲音,從而形成一首美妙的協(xié)奏曲。研究這個(gè)過(guò)程,能揭示細胞發(fā)育的規律?!?/p>
理解具有特定功能細胞的變化能力與規律
2009年,彭廣敦從中科院原上海生物化學(xué)與細胞生物學(xué)研究所博士畢業(yè),幾年后進(jìn)入中科院廣州生物醫藥與健康研究院,承擔國家重點(diǎn)研發(fā)計劃“干細胞及轉化研究”重點(diǎn)專(zhuān)項、中科院“器官重建與制造”戰略性先導科技專(zhuān)項等項目。2017年,廣州再生醫學(xué)與健康廣東省實(shí)驗室成立,彭廣敦加入實(shí)驗室細胞譜系中心,從事干細胞發(fā)育譜系方面的研究。
干細胞可以在實(shí)驗室里培養,不斷增殖,分化為人體中需要的各種功能性細胞。應用這些分化出來(lái)的功能細胞,就有可能實(shí)現再生醫學(xué)的治療方式。近年來(lái),干細胞與再生醫學(xué)研究越來(lái)越引人關(guān)注。但如何認識并獲得合適的干細胞,是目前相關(guān)領(lǐng)域的研究瓶頸。
彭廣敦一直想找到胚胎發(fā)育中時(shí)間和空間的編碼規律?!芭咛グl(fā)育就像是建造一座建筑,早期時(shí)段會(huì )繪制一張藍圖,以后各細胞成長(cháng)的走向都依照藍圖來(lái)進(jìn)行?!彼f(shuō)。
“但用一張圖來(lái)解釋胚胎的發(fā)展過(guò)程還遠遠不夠,需要很多張圖,記錄不同時(shí)期的胚胎發(fā)展,形成一部‘動(dòng)畫(huà)’?!迸韽V敦的研究,就是描繪胚胎發(fā)展的時(shí)間和空間變化圖,從而清晰地追蹤這些細胞從哪里來(lái),經(jīng)歷了怎樣的過(guò)程,又去向哪里。
他介紹,通過(guò)獲得這些具有特定功能的細胞,理解細胞變化的能力和規律,從而將其進(jìn)行移植或者再造應用,可以為未來(lái)的醫學(xué)發(fā)展打開(kāi)一扇新的窗口。
進(jìn)行跨學(xué)科研究,新技術(shù)帶來(lái)新思路
彭廣敦博士畢業(yè)后,本打算去企業(yè)工作。偶然間,他得到了一個(gè)計算生物學(xué)研究領(lǐng)域的工作機會(huì )。然而,對于沒(méi)有編程基礎的彭廣敦來(lái)說(shuō),這意味著(zhù)必須邊工作邊自學(xué)。新領(lǐng)域帶來(lái)的壓力,反而成了極大的動(dòng)力,讓他看到了從事科研新的可能,也更加堅定了他要繼續走科研之路的決心。
這段跨界經(jīng)歷,為彭廣敦做研究提供了新思路。他發(fā)現,將編程計算技術(shù)融入傳統生物學(xué)研究中,通過(guò)測序并結合計算機對數據信息進(jìn)行挖掘,可以實(shí)現多角度、連續動(dòng)態(tài)無(wú)偏差地觀(guān)察細胞的變化路徑。
彭廣敦和他的團隊發(fā)現,此前單細胞分析方法會(huì )丟失細胞在體內原有的位置信息,“鋪陳藍圖這個(gè)時(shí)期的胚胎直徑只有300微米,比一根頭發(fā)絲還細,要結合新的更精密的技術(shù)方法組合分析?!?/p>
在經(jīng)歷反復搭建、嘗試新的技術(shù)體系之后,2019年,彭廣敦課題組聯(lián)合其他課題組共同繪制了細胞成長(cháng)軌跡三維立體圖,發(fā)表在國際學(xué)術(shù)期刊上。
這項研究首次構建了小鼠早期胚胎著(zhù)床后發(fā)育時(shí)期高分辨率時(shí)空轉錄組圖譜,獲得了超2萬(wàn)個(gè)基因從時(shí)間和空間上的表達模式;首次從分子層面揭示了內胚層譜系的新來(lái)源,為理解胚層譜系建立及多能干細胞的命運調控機制,提供了翔實(shí)的數據,也為基于干細胞的再生醫學(xué)研究提供了全新思路。
“做科研最快樂(lè )的地方,是取得一點(diǎn)進(jìn)步,就很有獲得感?!迸韽V敦說(shuō)。目前,這項技術(shù)已成功應用于小鼠大腦發(fā)育、肝臟腫瘤學(xué)等研究中,能夠還原生理、病理狀態(tài)下組織和器官層面重要的分子動(dòng)態(tài)特征。
科研是長(cháng)期的事業(yè),張弛有度才能持久
彭廣敦的科研之路并非一帆風(fēng)順,“每往前走一步,往往會(huì )有更多問(wèn)題?!迸韽V敦說(shuō)。
回憶起剛開(kāi)始帶團隊做科研的經(jīng)歷,彭廣敦坦言遇到過(guò)不少坎,“團隊一開(kāi)始沒(méi)有知名度,招學(xué)生都難,只能四處推銷(xiāo)自己?!眻F隊早期招來(lái)的學(xué)生,學(xué)科背景跨度比較大,數學(xué)、工程、人工智能、生物等專(zhuān)業(yè)都有。每次開(kāi)組會(huì ),彭廣敦會(huì )花更多時(shí)間去講解實(shí)驗的意義和進(jìn)展,讓大家更充分地投入研究,激發(fā)持續探索的動(dòng)力。
科研創(chuàng )新需要跨學(xué)科的人才。漸漸地,彭廣敦發(fā)現多學(xué)科的團隊常常帶來(lái)意外收獲。成員間的互相討論,經(jīng)常碰撞出思維的火花,“大家相互啟發(fā)、打氣,感覺(jué)自己并不孤單,充滿(mǎn)干勁?!痹谒磥?lái),向他人學(xué)習有助于保持清醒,不斷突破已有的認知框架,追尋新的發(fā)現。
細胞成長(cháng)軌跡三維立體圖的研究成果發(fā)表后,彭廣敦的壓力更大了。他發(fā)現,近兩年,國際上相關(guān)領(lǐng)域的研究逐漸增多,有的團隊在人員、設備、技術(shù)上都很有優(yōu)勢?!敖┠?,國內基礎研究的創(chuàng )新氛圍愈發(fā)濃厚,鼓勵嘗試、允許試錯?!迸韽V敦說(shuō):“但時(shí)間、資源有限,如果長(cháng)期摸索不到正確的方向,就面臨著(zhù)錯過(guò)機會(huì )的風(fēng)險?!?/p>
如何排解科研的緊迫感帶來(lái)的壓力?出生于文藝家庭的彭廣敦在工作之余,常從音樂(lè )、書(shū)籍中得到心靈的放松。交響樂(lè )、科幻小說(shuō)中的詞語(yǔ),也常常變成他在研究中形象生動(dòng)的比喻,啟發(fā)他從新角度看待科研。
“科研是長(cháng)期的事業(yè),張弛有度才能持久。保持好的心態(tài),才能更好地做科研?!蔽磥?lái),彭廣敦與團隊希望在干細胞時(shí)空譜系研究上繼續取得突破。
?。ㄔd于《人民日報》 2021-04-26 12版)
附件下載: