發(fā)布時(shí)間:2018-02-12來(lái)源:供稿:干細胞所 鮑習琛
北京時(shí)間2月13日零點(diǎn),中國科學(xué)院廣州生物醫藥與健康研究院在Nature Methods(《自然-方法學(xué)》)雜志在線(xiàn)發(fā)表了分離RNA結合蛋白的新技術(shù),該技術(shù)是全面分析細胞內的RNA-蛋白相互作用的重要工具,有助于揭開(kāi)基因組中的“暗物質(zhì)”-非編碼RNA的未知功能。
有數以百計的蛋白質(zhì)可以與RNA結合,其中很多涉及神經(jīng)退行性病變、自身免疫缺陷和癌癥等疾病。那么,如何系統地分離RNA結合蛋白的問(wèn)題變得引人注目。前期科學(xué)家們系統地分離了細胞內mRNA結合蛋白,這只是眾多轉錄本中的一部分,細胞還包含了很多非polyA RNA。
廣州生物院研究員Miguel A. Esteban(米格爾·埃斯特班)、張必良和副研究員鮑習琛領(lǐng)銜的科研團隊設計了RICK(Newly Transcribed RNA interactome using click chemistry)技術(shù),利用核酸標記技術(shù),巧妙地將新合成的RNA標記上生物素,通過(guò)鏈霉親和素偶聯(lián)的磁珠,分離得到相應被標記RNA分子和與其相結合的蛋白分子。
通過(guò)這一技術(shù),研究人員系統地分離了包括非polyA尾RNA和新生RNA在內的一系列RNA分子及其結合蛋白。進(jìn)一步地分析發(fā)現,細胞分裂調控因子作為新的RNA結合蛋白,存在結合非polyA尾RNA的潛能。研究人員縮短標記的時(shí)間,成功地在細胞中分離了新生RNA結合蛋白。這些蛋白與新生RNA的轉錄及后續的加工、剪切等調控密切相關(guān)。這一技術(shù)的應用將有助于深入地剖析RNA結合蛋白的作用機制,也是細胞命運轉變過(guò)程中分析RNA蛋白相互作用的重要工具。
研究工作獲得國家重點(diǎn)研發(fā)計劃項目、國家自然科學(xué)基金委、廣州珠江科技新星、中科院青年創(chuàng )新促進(jìn)會(huì )等項目的資助。
RICK技術(shù)原理圖
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