干細胞全能性對理解哺乳動(dòng)物早期胚胎發(fā)育及再生醫學(xué)應用至關(guān)重要。然而，傳統胚胎干細胞（Embryonic stem cells，簡(jiǎn)稱(chēng)為ES細胞）向胚外組織發(fā)育的潛能有限，不具備全能性，在模擬早期胚胎發(fā)育及再生醫學(xué)應用等方面具有局限性。北京大學(xué)鄧宏魁教授團隊和香港大學(xué)劉澎濤教授團隊于2017年報道了通過(guò)小分子化合物將傳統ES細胞誘導成為兼具胚內及胚外發(fā)育潛能的類(lèi)全能性干細胞，并將其命名為擴展潛能干細胞（Extended pluripotent stem cells 或Expanded potential stem cells，簡(jiǎn)稱(chēng)為EPS細胞）。EPS細胞為組織再生提供了重要的種子細胞，具有重要的應用價(jià)值。然而，調控EPS細胞擴展潛能性的分子機制仍不清楚。 

　　北京時(shí)間4月16日，中國科學(xué)院廣州生物醫藥與健康研究院姚紅杰研究員課題組在《核酸研究》（Nucleic acids research）上以“突破性研究論文”（Breakthrough Article）形式在線(xiàn)發(fā)表了題為YY1 safeguard multidimensional epigenetic landscape associated with extended pluripotency的研究論文。該研究揭示了陰陽(yáng)因子YY1調控干細胞擴展潛能性的表觀(guān)遺傳新機制。 

　　研究人員繪制了ES細胞和EPS細胞的染色質(zhì)開(kāi)放圖譜，發(fā)現YY1顯著(zhù)富集在EPS細胞染色質(zhì)特異開(kāi)放區域，暗示其對EPS細胞具有潛在的調控作用。研究人員發(fā)現YY1可以通過(guò)介導（Enhancer）與啟動(dòng)子（Promoter）的相互作用維持EPS細胞特異基因的表達，包括Dnmt3l及Epas1等與胎盤(pán)發(fā)育相關(guān)基因。研究人員進(jìn)一步揭示敲降Yy1使DNA甲基化相關(guān)因子DNMT3A，DNMT3B及DNMT3L的表達下調，進(jìn)而導致EPS細胞的全基因組甲基化水平顯著(zhù)降低。隨后，研究人員發(fā)現DNA甲基化水平的減弱促進(jìn)了DNA敏感結合蛋白CCCTC結合因子（簡(jiǎn)稱(chēng)CTCF）在這些區域的結合，并使CTCF在組蛋白H3K4me3去甲基化酶5C（Kdm5c）和組蛋白去乙酰酶6（Hdac6）基因上介導的EP相互作用增強，促進(jìn)Kdm5c和Hdac6的表達，并導致EPS細胞特異基因啟動(dòng)子區域H3K4me3和H3K27ac的富集水平顯著(zhù)減弱。同時(shí)，研究人員發(fā)現敲降Yy1導致EPS細胞的基因表達模式接近于ES細胞，而過(guò)表達Yy1使部分EPS特異基因在ES細胞中表達。為了探究YY1是否可以調控EPS細胞的胚外發(fā)育潛能，研究人員進(jìn)一步利用體外胚外細胞分化系統結合單細胞轉錄組測序技術(shù)，發(fā)現敲降Yy1使EPS細胞向胚外內胚層（Extra-embryonic endoderm，XEN）樣細胞的衍生能力減弱，揭示YY1是EPS細胞維持胚外發(fā)育潛能所必需的因子。 

　　該研究揭示了YY1在調節表觀(guān)遺傳crosstalk中發(fā)揮著(zhù)極其重要的作用，并闡明YY1通過(guò)調控DNA甲基化和組蛋白修飾的二維層面和染色質(zhì)高級結構的三維層面，進(jìn)而調控EPS細胞的特性和分化潛能。 

　　姚紅杰研究員課題組的董曉濤博士及博士研究生郭蓉為該文章的并列第一作者。姚紅杰研究員為該文章的通訊作者。該研究得到了北京大學(xué)鄧宏魁教授和徐君研究員的大力幫助。該研究成果得到了國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、國家杰出青年科學(xué)基金、國家自然科學(xué)基金聯(lián)合基金重點(diǎn)項目和中國科學(xué)院戰略性先導科技專(zhuān)項等項目的資助。  

　　論文鏈接

YY1調控EPS細胞擴展潛能性的新機制

YY1是EPS細胞特性的捍衛者