提出疾病關(guān)聯(lián)分析應充分使用測序技術(shù)而非基因分型技術(shù)
10月4日,由深圳華大基因與加州大學(xué)伯克利分校、哥本哈根大學(xué)等單位合作的研究成果 “對200個(gè)人類(lèi)外顯子的測序揭示大量低頻率非同義突變的存在”在國際著(zhù)名學(xué)術(shù)雜志《自然—遺傳學(xué)》(Nature Genetics)上發(fā)表。這是中外科學(xué)家在人類(lèi)基因組研究領(lǐng)域取得的又一項重要成果。
該研究對200個(gè)丹麥個(gè)體蛋白質(zhì)編碼基因的外顯子組進(jìn)行了深度測序,發(fā)現了大量以往未知的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(SNP),其中大部分在人群中都以較低頻率出現。該研究完成了目前在人類(lèi)外顯子區域規模最大、分辨率最精細的遺傳圖譜,并以翔實(shí)的數據證明,人群當中的低頻率多態(tài)性位點(diǎn)富集了大量能引起蛋白質(zhì)氨基酸序列改變的變異,而這類(lèi)變異在人群中受到自然選擇作用,可能具有影響人類(lèi)健康的功能。
最近有多項科學(xué)研究指出,以往對多基因控制的復雜疾病所進(jìn)行的關(guān)聯(lián)分析研究盡管從理論上可行,并在實(shí)踐中發(fā)現了許多疾病關(guān)聯(lián)基因,但卻僅能解釋復雜疾病遺傳性的一小部分。這一現象被稱(chēng)為“遺傳度缺失”,是當前復雜疾病基因組研究的一個(gè)主要難題。此研究首次證實(shí),影響人類(lèi)健康和疾病易感性的多態(tài)性位點(diǎn)在人群中往往頻率低,但是相關(guān)位點(diǎn)的個(gè)數很多。既往的復雜疾病關(guān)聯(lián)分析使用的基因分型芯片僅對常見(jiàn)多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行測定,而無(wú)法研究低頻率多態(tài)性位點(diǎn),從而漏掉大量疾病關(guān)聯(lián)位點(diǎn),造成“遺傳度缺失”。該研究不僅指出了目前主流疾病研究方法的缺陷,并顛覆性地提出疾病關(guān)聯(lián)分析應充分使用測序技術(shù)而非基因分型技術(shù),從而對改變科學(xué)家對復雜疾病的研究手段,推動(dòng)人類(lèi)健康與醫學(xué)研究的進(jìn)步具有里程碑意義。
更多閱讀