近日,國內首個(gè)乙型肝炎病毒基因多功能共享數據庫在解放軍302醫院建成并投入使用,其收錄了我國10000余例患者乙型肝炎病毒基因序列、基因克隆和相關(guān)臨床資料,具有較強的生物信息學(xué)分析功能,為研究我國患者乙型肝炎病毒基因變異與耐藥、分子致病機制、疫苗設計和免疫應答等提供了共享信息平臺,也可為臨床合理制訂抗病毒治療方案提供幫助。
據全軍傳染病研究所副所長(cháng)、解放軍302醫院徐東平研究員介紹,這個(gè)數據庫具有序列數據量大、數據資源免費共享的特點(diǎn),并可系統地檢測和監控核苷(酸)類(lèi)抗病毒藥物耐藥變異;此外,該數據庫還在不斷收錄新的病例資料和序列信息,具有可擴充性。該數據庫目前已收錄了2000多個(gè)代表性病毒基因克隆,收錄了耐藥變異、抗病毒藥物治療和臨床應答指標等相關(guān)信息。
數據庫具有多種實(shí)用生物信息學(xué)分析功能,包括序列相似性比對、基因亞型分析、HBV血清型分析、核苷類(lèi)似物耐藥位點(diǎn)分析、特異性T淋巴細胞表位分析、病毒基因組系統進(jìn)化樹(shù)分析以及個(gè)性化數據篩選分析功能,能從核酸和蛋白兩個(gè)層次,對HBV各個(gè)功能區不同長(cháng)度的序列多態(tài)性進(jìn)行統計。數據庫已在多家醫療與科研單位進(jìn)行了應用,取得了預期效果,目前已正式聯(lián)網(wǎng)運行。