發(fā)布時(shí)間:2015-09-07來(lái)源:黃博純 供稿:干細胞所 劉興國 科教處 黃洲萍
9月1日,Cell出版社生物物理學(xué)權威雜志Biophysical Journal在線(xiàn)發(fā)表了中科院廣州生物醫藥與健康研究院劉興國研究組的研究成果“Modeling of Mitochondrial Donut Formation”。該研究針對缺氧/復氧病理條件下線(xiàn)粒體應答的新形態(tài)-“甜甜圈(donut)”,首次通過(guò)構建3D動(dòng)態(tài)數學(xué)模型計算結構轉換中的自由能變化,論證了線(xiàn)粒體“甜甜圈”形成的自發(fā)性和“甜甜圈”存在的穩定性。
缺氧/復氧過(guò)程廣泛存在于心腦血管、腎病等多種疾病以及人工手術(shù)過(guò)程中,比如心臟缺血再灌注,在這個(gè)過(guò)程中,在缺血時(shí)組織細胞面臨缺氧和葡萄糖缺乏導致的饑餓,恢復供血后細胞突然大量死亡,造成器官壞死和功能異常。研究組以此病理學(xué)為基礎,在前期研究中發(fā)現線(xiàn)粒體應答的新形態(tài)-“甜甜圈”,這一“甜甜圈”形態(tài)的線(xiàn)粒體在環(huán)境條件恢復正常時(shí)可以迅速恢復膜電勢,恢復正常呼吸功能。然而,缺氧/復氧病理條件下線(xiàn)粒體由正常的線(xiàn)狀或粒狀變?yōu)椤疤鹛鹑Α钡牧W(xué)機制和能量過(guò)程一直不清楚。
本研究精確測量了線(xiàn)粒體的直徑,并統計線(xiàn)粒體“甜甜圈”環(huán)結構直徑的數值分布(95%大于0.8微米)。在此基礎上,本研究構建了3D光滑曲面的“幾何線(xiàn)粒體”模型,通過(guò)對曲面任意點(diǎn)的積分定量線(xiàn)粒體的3D空間信息,因此這一模型可以模擬線(xiàn)粒體的實(shí)時(shí)動(dòng)力學(xué):膨脹/縮小,融合/分裂,彎曲和變身為有尾巴和無(wú)尾巴的兩種“甜甜圈”。研究組通過(guò)計算線(xiàn)粒體從線(xiàn)狀變身為“甜甜圈”的過(guò)程中彎曲能和滲透壓能的變化,構建了這一過(guò)程自由能變化模型。結果表明,彎曲能是線(xiàn)粒體變身為“甜甜圈”的主要障礙,而“甜甜圈”直徑小于0.8微米將帶來(lái)極大的自由能增加。這一模擬計算的結論與實(shí)際觀(guān)察的“甜甜圈”環(huán)結構直徑的數值分布完全一致。
細胞能量狀態(tài)和亞細胞結構轉換一直是外界信號調控的兩大方面。本研究建立了3D動(dòng)態(tài)數學(xué)模型,論證了線(xiàn)粒體結構轉換中的能量控制機制,是細胞能量狀態(tài)和亞細胞結構轉換之間相互作用的范例。線(xiàn)粒體處于不斷的動(dòng)態(tài)中,這對于細胞的“生老病死”非常重要。本研究針對缺氧/復氧這一重要病理條件下,線(xiàn)粒體應答外界壓力變身為新形態(tài)“甜甜圈”,闡明了這一過(guò)程發(fā)生的自發(fā)性和“甜甜圈”存在的穩定性,是線(xiàn)粒體適應性動(dòng)力學(xué)應答的新模式。
本研究獲得中科院、科技部、國家自然科學(xué)基金、廣東省和廣州市的經(jīng)費支持。
線(xiàn)粒體變身“甜甜圈”
線(xiàn)粒體變身“甜甜圈”的自由能曲線(xiàn)
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