發(fā)布時(shí)間:2020-10-13
10月8日,中國科學(xué)院廣州生物醫藥與健康研究院秦寶明和Miguel A. Esteban課題組在Nature Communications雜志在線(xiàn)發(fā)表了題為“JMJD3 acts in tandem with KLF4 to facilitate reprogramming to pluripotency”的研究論文。
早前,團隊(裴端卿、Miguel A. Esteban、王濤、秦寶明及其他成員)報道了維生素C(Vc)極大提高體細胞重編程效率,這一作用并非通過(guò)其經(jīng)典的抗氧化活性,而是來(lái)自其抑制細胞衰老以及促進(jìn)多能性相關(guān)基因的激活。根據以往有關(guān)Vc在干細胞以及細胞命運轉變中的眾多零散發(fā)現,研究人員推斷Vc的這些豐富的作用很可能來(lái)自其作為二價(jià)鐵的特異性還原劑,維持或激活一類(lèi)二價(jià)鐵和a酮戊二酸依賴(lài)的雙加氧酶的活性,其中包括負責調控表觀(guān)遺傳的組蛋白和DNA去甲基化Jumonji家族和TET家族。后續團隊是以Vc為有力工具,對這兩類(lèi)重要的表觀(guān)遺傳調控酶家族開(kāi)展了一系列探索,先后報道了JHDM1B、KDM3/4和TET1等對重編程的作用和機制,大大增進(jìn)了人們對甲基化修飾在細胞命運維持和轉變中的作用和機制的認知。同時(shí),更多新的表觀(guān)遺傳機制在細胞命運轉變中的機制有待發(fā)現。
作為個(gè)體發(fā)育和干細胞分化中最重要的組蛋白修飾之一,H3K27me3標記發(fā)育分化基因并抑制其表達,在基因組水平H3K27me3的動(dòng)態(tài)變化是發(fā)育和分化得以有序進(jìn)行的重要基礎。體細胞重編程是發(fā)育和分化的逆向過(guò)程,H3K27me3勢必經(jīng)歷逆向的時(shí)空變化。此外,相當一部分多能性以及上皮相關(guān)基因在初始成纖維細胞中都被H3K27me3修飾,這些基因的激活伴隨H3K27me3去甲基化。因此團隊推斷,H3K27me3的去甲基化可能是重編程必需的限速環(huán)節。
在哺乳動(dòng)物中,負責H3K27me3的去甲基化酶主要有UTX(即KDM6A)和JMJD3(即KDM6B),除了非常相似的去甲基化酶活性結構域,兩者在結構和功能都存在顯著(zhù)差異。以往研究報道,UTX是重編程中眾多多能性相關(guān)基因激活所必需的,而JMJD3則通過(guò)2種途徑抑制重編程,即激活細胞衰老以及降解多能性相關(guān)因子PHF20。這2項研究都是在沒(méi)有Vc的條件下開(kāi)展的,團隊于是提出問(wèn)題:在Vc條件下,JMJD3和UTX對重編程發(fā)揮怎樣的作用?
團隊發(fā)現,UTX與報道一致,而JMJD3對重編程則有2方面相反的作用。一方面,在傳代后期出現衰老特征的小鼠胚胎成纖維細胞(MEF)中,與以往報道一致,JMJD3通過(guò)激活I(lǐng)nk4a/Arf抑制重編程,而且這一效應與重編程無(wú)關(guān);另一方面,在傳代早期年輕的MEF中,JMJD3提高重編程效率并且Vc能大大加強這一作用;在機制上,JMJD3被KLF4特異性地招募至上皮和多能性基因位點(diǎn),并輔助KLF4激活這些基因。進(jìn)一步,團隊還在多種其他KLF4介導的細胞命運轉變中驗證了JMJD3的這一作用模式。因此,本研究對深入理解KLF4和JMJD3在相關(guān)發(fā)育、干細胞分化、生理和疾病條件下的復雜作用具有提示意義?!?nbsp;
本研究在秦寶明和Miguel A. Esteban兩位研究員共同指導下,由本院黃穎華博士和生物島實(shí)驗室張輝博士共同完成,并得到了來(lái)自南方科技大學(xué)Andrew P. Hutchins教授、吉林大學(xué)胡繼繁教授、本院裴端卿、陳捷凱、潘光錦、賴(lài)良學(xué)、鄭輝、鮑習琛等多位研究員、日本大阪大學(xué)Shizuo Akira教授、香港大學(xué)Ralf Jauch教授等眾多同事和國內外同行的幫助和支持。在經(jīng)費上,該工作得到了國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金、生物島實(shí)驗室、中國科學(xué)院再生生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗室、廣東省干細胞與再生醫學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗室、廣東省和廣州市科技計劃等多個(gè)項目的支持。
廣州健康院揭示H3K27me3去甲基化酶JMJD3與KLF4在體細胞重編程中協(xié)同調控轉錄的新機制
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