發(fā)布時(shí)間:2018-02-13來(lái)源:來(lái)源:科學(xué)網(wǎng)
科學(xué)網(wǎng)廣州2月13日訊 記者從中國科學(xué)院廣州生物醫藥與健康研究院獲悉,該院研究員米格爾?埃斯特班、張必良和副研究員鮑習琛領(lǐng)銜的科研團隊開(kāi)發(fā)RICK技術(shù)首次分離RNA結合蛋白。該技術(shù)是全面分析細胞內的RNA-蛋白相互作用的重要工具,有助于揭開(kāi)基因組中的“暗物質(zhì)”-非編碼RNA的未知功能。相關(guān)研究2月13日在線(xiàn)發(fā)表在《自然-方法學(xué)》。
有數以百計的蛋白質(zhì)可以與RNA結合,其中很多涉及神經(jīng)退行性病變、自身免疫缺陷和癌癥等疾病。那么,如何系統地分離RNA結合蛋白的問(wèn)題變得引人注目。前期科學(xué)家們系統地分離了細胞內mRNA結合蛋白,這只是眾多轉錄本中的一部分,細胞還包含了很多非polyA RNA。
研究人員設計了RICK(Newly Transcribed RNA interactome using click chemistry)技術(shù),利用核酸標記技術(shù),巧妙地將新合成的RNA標記上生物素,通過(guò)鏈霉親和素偶聯(lián)的磁珠,分離得到相應被標記RNA分子和與其相結合的蛋白分子。通過(guò)這一技術(shù),研究人員系統地分離了包括非polyA尾RNA和新生RNA在內的一系列RNA分子及其結合蛋白。
進(jìn)一步分析發(fā)現,細胞分裂調控因子作為新的RNA結合蛋白,存在結合非polyA尾RNA的潛能。研究人員縮短標記的時(shí)間,成功地在細胞中分離了新生RNA結合蛋白。這些蛋白與新生RNA的轉錄及后續的加工、剪切等調控密切相關(guān)。這一技術(shù)的應用將有助于深入地剖析RNA結合蛋白的作用機制,也是細胞命運轉變過(guò)程中分析RNA蛋白相互作用的重要工具。
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